Les projets de recherche menés dans le cadre d’un Programme national de recherche (PNR) doivent contribuer à résoudre des problèmes actuels importants. C’est le Conseil fédéral qui détermine les questions et grands axes étudiés par le PNR et qui charge le Fonds national suisse de l’exécuter.
Dans le cadre d’un PNR, les projets de recherche issus de différentes disciplines et institutions sont coordonnés et orientés vers un objectif commun. Ils doivent remplir les conditions suivantes: les programmes nationaux de recherche se penchent sur des sujets significatifs pour l’ensemble de la Suisse, ne font pas de recherche propre à l’administration ou proche de l’industrie, sont par conséquent indépendants des fonds de l’industrie et doivent mener en l’espace d’environ cinq ans à des résultats pouvant être exploités dans la pratique.